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三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

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歷經(jīng)三年抗疫歷程,十四億人一同走過的路途,絕非能用幾句口號(hào)予以概括。自武漢保衛(wèi)戰(zhàn)起始至終,直至奧密克戎遭遇戰(zhàn),我們憑借最小代價(jià)成功守住了最大多數(shù)人的生命健康安全,其背后是科學(xué)防控邏輯持續(xù)不斷地迭代更新,更是病毒與人類在微觀層面所展開的漫長博弈較量。

三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

三階段轉(zhuǎn)段不是規(guī)劃出來的而是打出來的

二零二零年年初之際的武漢,在除夕夜之時(shí),有醫(yī)療隊(duì)登上了朝著天河機(jī)場(chǎng)而去的飛機(jī),那時(shí)我們對(duì)于新冠病毒堪稱幾乎全然一無所知,僅僅卻只能在極為短暫的時(shí)間范圍之內(nèi)構(gòu)筑起步建立集中起患者、專家以及資源的應(yīng)急相關(guān)機(jī)制,歷經(jīng)七十六天的封控歷程,有著一千八百一十四例確診病例獲得救治,這并非是冷冰冰沒有情感的數(shù)字模樣形態(tài),而是成為了后續(xù)所有防控政策的由本土所產(chǎn)生的經(jīng)驗(yàn)源泉源頭所在之處。

在2021年,德爾塔變異株傳入之際,我們進(jìn)而達(dá)成了在24小時(shí)之內(nèi)去劃定風(fēng)險(xiǎn)區(qū),于48小時(shí)之內(nèi)完成重點(diǎn)區(qū)域核酸檢測(cè)。廣州乃至南京以及西安等地諸多起聚集性疫情被快速消滅,流調(diào)人員打電話直至嗓音變得嘶啞,社區(qū)網(wǎng)格員的三輪車裝滿了蔬菜包。此階段并非進(jìn)行全員靜默,而是精準(zhǔn)到單元樓棟。

2022年年底的時(shí)候,進(jìn)入到了過渡轉(zhuǎn)段的階段,北京、重慶、保定等好些城市,差不多是在同一時(shí)間,感受到了醫(yī)療資源承受壓力,然而,發(fā)熱門診是應(yīng)開盡開的狀態(tài),分級(jí)診療也很快就達(dá)成了落地實(shí)施,布洛芬的產(chǎn)能,從每月生產(chǎn)80億片被提升到了一天能生產(chǎn)2億片,不存在哪個(gè)國家是毫無代價(jià)就度過疫情的這種情況,我們所選擇的做法是,把代價(jià)加諸在產(chǎn)能、物流以及醫(yī)護(hù)人員的肩膀之上,并非是加諸在重癥患病老人所使用的呼吸機(jī)之上。

病毒變異不是憑空發(fā)生的而是有跡可循的

SARS-CoV-2身為β冠狀病毒,刺突蛋白序列和2003年的SARS病毒有著約76%的相似度,然而其傳播能力遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過前者。南京醫(yī)科大學(xué)在2021年發(fā)表于《柳葉刀》的論文表明,武漢疫情期間分離出的毒株與穿山甲攜帶冠狀病毒的受體結(jié)合域相似度高達(dá)97%,這為中間宿主研究提供了關(guān)鍵線索。

病毒聚合酶欠缺校正功能,每一次進(jìn)行復(fù)制的時(shí)候都會(huì)產(chǎn)生點(diǎn)突變,英國劍橋團(tuán)隊(duì)在2020年3月時(shí)分是實(shí)施了對(duì)160個(gè)基因組的分析工作,結(jié)果發(fā)現(xiàn)全球之上展開傳播的主要毒株已然是從原始型分化成為了L型以及S型,直至2021年,Nextstrain平臺(tái)所顯示的進(jìn)化分支數(shù)量就已經(jīng)超過了1200條,Delta攜帶著的T478K突變致使膜融合效率得到了4倍的提升,這便是它成為優(yōu)勢(shì)株的根本緣由。

在2022年初的時(shí)候,重組機(jī)制引發(fā)了警惕,日本國立感染癥研究所報(bào)告了,Alpha和Delta在同一個(gè)宿主體內(nèi)進(jìn)行了重組,并且形成了嵌合病毒,此嵌合病毒具備兩種變體的關(guān)鍵突變,這可不是科幻情節(jié),而是東京某醫(yī)院同時(shí)感染兩名患者的真實(shí)標(biāo)本。

突變積累需要時(shí)間也需要觀測(cè)窗口

早期大流行時(shí),要去估算替代率,幾乎沒可能。2020年2月,全球共享的序列,還不足100條,核苷酸差異,只有個(gè)位數(shù)。一直到當(dāng)年5月,加州大學(xué)團(tuán)隊(duì),才首次推算出,新冠病毒每月,約累積1.1個(gè)突變,這樣的速率,是流感病毒的四分之一。

僅只是隨著感染基數(shù)的不斷擴(kuò)大,那替代率的估算才漸漸變得算得上可靠了。屬于英國的那個(gè)COG-UK聯(lián)盟于2021年4月的時(shí)候,對(duì)50萬條序列做了分析,,最終發(fā)現(xiàn)B.1.1.7分支,每個(gè)月都會(huì)固定增加2.5個(gè)氨基酸替換。這并非是因?yàn)椴《緩?fù)制的速度更快了,,而是在于它在大量人群的篩選過程當(dāng)中,持續(xù)不斷地篩選出了更易于傳播的突變。

三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

2022年,中國疾控中心進(jìn)行了披露,在天津奧密克戎疫情里,所檢出的BA.2毒株攜帶了S371F突變,該位點(diǎn)于2021年11月首次在南非被上報(bào),五個(gè)月之后,已在全球90%的測(cè)序樣本中出現(xiàn)了。這種固定速度并非偶然,而是病毒趨同進(jìn)化的鐵證。

重組是變異加速器不是小概率事件

有兩種不同變異株要進(jìn)行重組,這種情況的前提是什么呢?那就是它們要在同一時(shí)間感染同一個(gè)宿主才行。到了2021年年底,英國那邊報(bào)告首例XA譜系的時(shí)候,英格蘭公共衛(wèi)生局發(fā)現(xiàn)了什么情況呢?發(fā)現(xiàn)這名患者同時(shí)攜帶B.1.617.2和B.1.1.7這兩種病毒載體。重點(diǎn)來了,這可不是實(shí)驗(yàn)室里面制造出來的產(chǎn)物,它是在切實(shí)存在的平常生活里人與人之間的病毒傳播鏈條里自然而然發(fā)生的。

隨時(shí)間,重組體的檢出能力大幅提升。2022年3月,法國科學(xué)委員會(huì)通報(bào)了XF等重組譜系,通報(bào)中介紹在這些譜系里,刺突蛋白完全源自奧密克戎,可骨架蛋白卻來自Delta。這表明病毒的致病性或許由骨架決定,然而免疫逃逸能力是由刺突決定。

2022年初本地疫情進(jìn)行分析之際,香港大學(xué)團(tuán)隊(duì)察覺到了BA.2.12.1與BA.4重組后所形成的未知分支,盡管其尚未造成大規(guī)模傳播,然而卻證實(shí)了只要共循環(huán)這一情況存在,那么重組便會(huì)成為必然發(fā)生的事件,全球流感數(shù)據(jù)共享平臺(tái)里的數(shù)據(jù)表明,2022年被檢測(cè)出的重組事件數(shù)量乃是2021年的17倍。

病毒進(jìn)化受多重瓶頸反復(fù)塑造

變異存續(xù)的第一道篩子是傳播瓶頸,復(fù)旦大學(xué)2021年發(fā)表的一項(xiàng)研究顯示,感染者呼吸道里的病毒顆粒數(shù)量以億來計(jì)算,然而傳播給下一個(gè)人的奠基者群體通常僅有1至3個(gè)病毒顆粒,這表明即便大部分突變出現(xiàn)了,也根本不存在傳出去的機(jī)會(huì)。

某些突變頻率會(huì)被超級(jí)傳播事件隨機(jī)放大,在2021年5月廣州疫情里,Delta變異株借由一頓早茶便傳播了四代人,當(dāng)時(shí)測(cè)序表明,傳播鏈上的全部病例帶有完全一樣的S蛋白突變,這便是典型的奠基者效應(yīng)。

三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

隱蔽孵化器是慢性感染患者對(duì)于變異株而言的稱呼,英國劍橋大學(xué)追蹤了一名免疫缺陷患者,該患者感染新冠病毒之后持續(xù)帶毒102天,在這期間病毒于其體內(nèi)累積了23個(gè)氨基酸突變,其中7個(gè)出現(xiàn)在RBD區(qū)域,阿爾法變異株的多篇溯源論文都指向了與之類似的長期攜帶場(chǎng)景。

溯源是科學(xué)問題不是政治籌碼

三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

對(duì)于溯源研究這件事,中國科學(xué)家從來都沒有停止過。在2021年的時(shí)候,武漢病毒研究所針對(duì)17000多份蝙蝠樣本開展了宏基因組分析,然而卻沒有找到任何和新冠病毒有直接關(guān)聯(lián)的冠狀病毒序列。還是在同年,中國疾控中心針對(duì)2019年下半年武漢市獻(xiàn)血者留存的血樣進(jìn)行了抗體檢測(cè),最后1064份樣本的檢測(cè)結(jié)果全部都是陰性。

這些數(shù)據(jù)并非是在隔絕外界獨(dú)自搞出來的,有兩篇論文,它們各自刊載于《自然》以及《細(xì)胞》這本雜志的子刊上,在那其中數(shù)據(jù)是公開呈現(xiàn)的,方法也是透明度極其高的,病毒溯源從本質(zhì)上來說是與考古學(xué)有著相似之處的領(lǐng)域需要全球眾多不同地方的樣本慢慢進(jìn)行積攢,絕對(duì)無法僅僅憑借一個(gè)國家自身去證實(shí)自己沒問題,武漢為外界提供了最早時(shí)期的臨床樣本以及環(huán)境樣本,此情況已經(jīng)成為了國際科學(xué)界大家共同認(rèn)可的觀點(diǎn)。

關(guān)鍵進(jìn)展在動(dòng)物溯源方面也得到了獲取,東北林業(yè)大學(xué)團(tuán)隊(duì)于2022年在《病毒學(xué)雜志》上發(fā)表了文章,文中報(bào)告在了黑龍江的鹿群當(dāng)中檢出了與人類新冠病毒同源性高達(dá)99.8%的毒株,不過進(jìn)一步的分析表明了這是人類向鹿群的溢出事件,其方向清晰明確,和源頭沒有關(guān)聯(lián),溯源并非是去追究誰犯了錯(cuò)誤,而是對(duì)病毒怎樣跨越物種邊界進(jìn)行記錄。

三年抗疫成果顯著!新冠如何進(jìn)化及源頭在哪?

在過去的三年當(dāng)中,你有沒有過這樣的感覺,就是有些防控舉措顯得過于嚴(yán)格苛刻了呢?當(dāng)現(xiàn)在再回過頭去看的時(shí)候,你會(huì)不會(huì)想要重新去評(píng)估考量那些時(shí)段呢?歡迎在評(píng)論區(qū)域說出你自身的真實(shí)經(jīng)歷情況。